Il repertorio del Coro Polifonico Universitario, estremamente ampio, va dal Canto Gregoriano fino al '900 con brani di Walton, Stravinskij e contemporanei.

Comprende musica eseguita a cappella, con strumento e con orchestra.
In particolare con la Nuova Orchestra Scarlatti, con Il Discantus Ensemble ha eseguito brani di autori della Scuola Napoletana come Cimarosa (Il Magnificat), Paisiello (Requiem in do min), Durante (Missa Pastoralis). Inoltre ha curato l'esecuzione della Missa Brevis di Haydn e della Messe de Minuit di Charpentier.